Временное пребывание в России отца — гражданина Казахстана

Мой отец является гражданином Казахстана, но прописан и проживает в РФ, каждые три месяца он выезжает из страны и снова заезжает. Сотрудник миграционной службы района, в котором зарегистрирован мой отец, угрожает моему отцу депортацией из страны. Ранее, когда у него не было паспорта гражданина Казахстана, мы по факту его въезда в РФ, ставили его на учет в миграционной службе. Затем, когда он получил паспорт гражданина Казахстана, мы прописали его в частном доме, который принадлежит мне, там он и проживает. Сотрудник миграционной службы пояснил нам тогда, что более не требуется постановка его на учет каждые три месяца, т.к. у него теперь есть прописка на территории РФ. В связи со всем вышеизложенным у меня вопрос: Какими на самом деле должны быть наши действия, должны мы его по прежнему регистрировать каждые три месяца или нет?

Законно находящийся в Российской Федерации иностранный гражданин – это лицо, имеющее действительные вид на жительство, либо разрешение на временное проживание, либо визу и (или) миграционную карту, либо иные предусмотренные федеральным законом или международным договором Российской Федерации документы, подтверждающие право иностранного гражданина на пребывание (проживание) в Российской Федерации (ст. 2 Федерального закона от 25.07.2002 N 115-ФЗ «О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации»).
Иностранный гражданин, не имеющий вида на жительство или разрешения на временное проживание, является временно пребывающим в Российской Федерации иностранным гражданином.
В силу положений ст. 5 Федерального закона от 25.07.2002 N 115-ФЗ «О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации» срок временного пребывания в Российской Федерации иностранного гражданина, прибывшего в Российскую Федерацию в порядке, не требующем получения визы, не может превышать девяносто суток суммарно в течение каждого периода в сто восемьдесят суток, за исключением случаев, предусмотренных Федеральным законом.
Таким образом, иностранный гражданин, для того, чтобы в последствие иметь право законно находиться на территории Российской Федерации, должен выехать за ее пределы не менее чем на 90 суток.
Для непрерывного проживания на территории Российской Федерации иностранному гражданину требуется разрешение на временное проживание или вид на жительство.
Порядок получения разрешения на временное проживание в РФ и вида на жительство регулируется Федеральным законом от 25.07.2002 № 115-ФЗ «О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации».

При условии законного нахождения на территории РФ следует подать в отделение миграционной службы по месту пребывания заявление о выдаче разрешения на временное проживание.
Заявление о выдаче вида на жительство подается иностранным гражданином в территориальный орган федерального органа исполнительной власти в сфере миграции не позднее чем за шесть месяцев до истечения срока действия разрешения на временное проживание.

До получения вида на жительство иностранный гражданин обязан прожить в Российской Федерации не менее одного года на основании разрешения на временное проживание.